Воды Иртыша используются для питания канала Иртыш - Караганда (забор воды из Иртыша в канал в среднем 75 м³/с), для водоснабжения и орошения. Ниже озера Зайсан на Иртыше построен Иртышский каскад ГЭС. В 2010 году разработан проект строительства низконапорной плотины севернее Омска - Красногорский гидроузел. Проект осуществляется по целевой программе Омской области "Строительство Красногорского водоподъёмного гидроузла на реке Иртыш.